低溫冷庫是冷鏈系統中續接初期產品溫度急降后的一環，也是低溫產品在冷鏈系統中停留時間最長的據點，低溫冷庫大概分為冷藏和冷凍兩大類：冷藏倉庫以儲存蔬果、新鮮魚肉、魚卵、蛋、鮮奶、果汁等為主;冷凍倉庫則以儲存肉類、冰激淋等為主。

　　冷藏庫：凡是庫溫維持在產品凍結溫度以上的都屬于冷藏倉庫，一般生鮮食品的凍結點大都在-2度以上，由于各類產品性質的不同，庫溫也各有差異，大多數庫溫約在4度以下。

　　特殊冷藏庫:凡是需要同時控制庫內溫度、濕度的都屬于特殊冷藏庫，如新鮮蔬果的冷藏等。

　　冷凍庫:凡產品溫度維持在凍結溫度以下的都屬于冷凍倉庫，例如長期冷凍儲藏的凍結魚或肉，冷凍食品等的庫溫約在-23度以下。